【2016.10.06／新聞大聯盟巡迴特派記者劉戡宇報導】監察院針對台南市議會陳訴，台南市長賴清德、副市長顏純左及衛生局長林聖哲督導防疫系統失靈，防治登革熱措施未當，致登革熱疫情一發不可收拾，通過糾正台南市政府。
監委章仁香、江綺雯及方萬富於調查報告中指出，104年台南登革熱疫情長達6個月失控，造成該市22,760例登革熱病例，112人死亡，疫情確診病例及死亡人數為歷年之最，並指台南市長賴清德、副市長顏純左及衛生局長林聖哲等人，在督導防疫人員執行相關措施上，應予深切檢討。
監委調查報告共列出15項調查意見，其中針對台南市政府在執行孳生源清除及化學防治上未確實、無法有效並及早發現孳生源、化學防治用藥未依衛生福利部疾病管制署(下稱疾管署)指示、防疫指揮體系紊亂、社區動員不足……等提出10項缺失，並糾正其中5項；另有5項要求疾管署及行政院環境保護署檢討研議改善措施。
監察院糾正台南市政府之糾正案由為，一、 疏忽疫情：104年入夏第1例登革熱疑似病例通報及確診後，台南市政府未能及早發現孳生源，致病媒蚊密度不斷提升，無法阻斷登革熱病媒蚊傳播，造成群聚感染，疫情蔓延擴散。
二、 噴藥紊亂：為避免登革熱病媒蚊產生抗藥性，疾管署經藥效試驗結果，指示台南市政府104年化學防治藥劑使用期程及調配濃度，然該府在噴藥實施上，各行政區各行其是，用藥紊亂，化學防治無法有效發揮，疫情失控。
三、 指揮機制失序：台南市政府為對抗登革熱肆虐，訂有104年登革熱防治計畫區級疫情指揮中心成立條件，以及疫情緊急時，拉高指揮層級，成立市級登革熱流行疫情指揮中心，以進行防治工作之整合及統一指揮調度。然各區級指揮中心成立時間不一，有的甚至晚於市級指揮中心，除防疫各行其是，無法有效整合外，亦有上下指揮系統無法配合之情形，防疫指揮體系紊亂，致使疫情擴散。
四、 平時疏於專業培訓：臺南市政府104年登革熱化學防治作業，係採個案病例、區塊化學及防火牆區域防治進行，然因該府環境保護局施藥人員專業訓練過晚，無法有效配合各階段的化學防治措施，在家戶防治方面亦出現任由民眾自行施藥之亂象，化學防治成效不彰，造成該市病例於8月及9月份快速上升。
五、 未定期清除孳生源：登革熱之孳生源清除，係配合病媒蚊繁殖週期，需定期持續，方具成效，然台南市政府對於各行政區之社區動員情形未能掌握，疑有延宕且頻率過低；又防疫期間，社區動員進行孳生源清除工作執行不力，致疫情無法有效控制。
